Marek Špelina vystudoval příčnou flétnu na Konzervatoři v Plzni u profesorky Marie Kroupové. Během studií pravidelně navštěvoval kurzy Jiřího Stivína v jihočeské Bechyni, kde se začal intenzivně věnovat zobcové a později i barokní příčné flétně.
Dále absolvoval kurzy a hodiny u Nancy Hadden, Konrada Hüntelera, Pamely Thorby a Petera Holtslaga. Pravidelně spolupracuje jak se soubory hrajícími na autentické nástroje (Musica Florea, Ad Vocem, Musica Aeterna, Cappella Regia Musicalis, Kvinterna, Solamente Naturali, Collegium Marianum ...), tak s ansámbly hrajícími na nástroje moderní (Collegium Quodlibet Jiřího Stivína, Collegium Českých Filharmoniků, Cappella Istropolitana, Collegium Gabriely Demeterové).
Marek Špelina v současné době působí jako 1. flétnista operního orchestru DJKT v Plzni a vyučuje komorní hru, pikolu a orchestrální party na Konzervatoři v Plzni. Od roku 2002 je také lektorem třídy ansámblů zobcových fléten na Mezinárodní letní škole staré hudby ve Valticích. Zapomenout nesmíme ani na Tre Fontane
Vedle vážné hudby se věnuje i rockové hudbě. Hrál ve skupině Mercy Street, jako host vystupoval se skupinami Burma Jones a Darrell Standing a v současnosti je členem skupiny Hibaj.