Orangutani jsou uvedeni v Červeném seznamu ohrožených druhů zvířat. Podle odhadu žije v přírodě jen 50 000 - 55 000 ohrožených orangutanů bornejských a pouhých 6 000 - 6500 kriticky ohrožených orangutanů sumaterských.
Oba druhy ohrožuje hlavně ztráta životního prostředí, neboť lesy jsou ničeny kácením, požáry nebo přeměňovány na palmové plantáže. I když je orangutan chráněn zákonem, jeho mláďata jsou stále chytána a ilegálně prodávána jako domácí mazlíčci. Při nízké reprodukční schopnosti jejich počty klesají, i když v poslední době byly v pralesích nalezeny dosud nezmapované populace. Je propočteno, že orangutani ztrácejí 2,5 % svého životního prostředí ročně. někteří vědci varují, že při současném tempu kácení a vypalování deštných lesů vyhyne orangutan bornejský do roku 2050 a orangutan sumaterský ještě dříve. Orangutany chrání Washingtonská konvence omezující obchodování s ohroženými druhy (CITES).
| Rok | Borneo | Sumatra | Celkem |
| 1990 | 230 000 | 85 000 | 315 000 |
| 1996 | 23 000 | 12 000 | 35 000 |
| 1997* | 15 000 | 12 000 | 27 000 |
| 2008** | 54 000 | 6 000 | 60 000 |
| * po požárech na Borneu |
| ** zdánlivě došlo k nárůstu populace, ale ve skutečnosti byly nalezeny nové populace na Borneu |
Orangutani jsou lidoopi nejvíce ohrožení vyhubením, na jejich záchranu se budují odchovná střediska, kde se učí mláďata samostatnosti, aby byla připravena na život ve volné přírodě. Jsou to mláďata pocházející ze zajetí, nebo zabavená překupníkům. Orangutany se daří chovat v zoologických zahradách, které mohou pomoci druhu přežít. v současné době je v nich chováno 710 jedinců.
[
